Khu công nghiệp cảng Sa Đéc do Công ty HIDICo làm chủ đầu tư.

Tiếp đến, Cục Thuế tỉnh có thông báo nộp tiền, ghi rõ tiền thuê đất là gần 9 tỉ và tiền chậm nộp là hơn 14 tỉ đồng.

Cho là số tiền cao, HIDICo khiếu nại nên tháng 8-2017, Cục Thuế tỉnh Đồng Tháp có văn bản phản hồi về số tiền chậm nộp là áp dụng theo Nghị định 135/2016 của Chính phủ, đồng thời ra thông báo và quyết định cưỡng chế về thuế.

Bốn tháng sau, Đồng Tháp có quyết định thanh tra về việc chấp hành pháp luật về quản lý, sử dụng đất đai; thực hiện nghĩa vụ tài chính về đất đai tại dự án trên và đến tháng 6-2018, Thanh tra tỉnh có kết luận.

Trong đó, với khoản tiền thuê đất, chậm nộp, thanh tra nêu rõ: Việc Sở Tài chính tham mưu UBND tỉnh ban hành công văn phê duyệt tiền thuê đất đối với HIDICo là chưa phù hợp với quy định; với khoản tiền chậm nộp, thanh tra cho là “phải căn cứ Nghị định 142/2005 về “thu tiền thuê đất, thuê mặt nước” để tính trong khoảng thời gian từ năm 2006 đến tháng 3-2011. Theo đó, tỉ lệ mà Công ty HIDICo phải trả tiền chậm nộp là 0,02%/ngày. Thanh tra tỉnh kiến nghị chủ tịch UBND tỉnh có văn bản chỉ đạo, các sở, ban, ngành có liên quan thực hiện.

Thực hiện việc này, ngày 31-8 vừa qua, Sở Tài chính chủ trì cuộc họp, thống nhất tính khoản tiền chậm nộp cho HIDICo (giảm hơn 3 tỉ đồng so với ban đầu).

Tỉnh theo hướng dẫn, phạt nặng doanh nghiệp

Tuy nhiên, trong khi chờ kết luận thanh tra, Cục Thuế tỉnh Đồng Tháp có văn bản hỏi ý kiến Tổng cục Thuế về việc chậm nộp của doanh nghiệp. Và khi kết luận thanh tra đã ban hành, Tổng cục Thuế có văn bản phản hồi cho Cục Thuế tỉnh Đồng Tháp.

Theo văn bản này, về số tiền chậm nộp của HIDICo, ngành thuế phải áp dụng Luật Quản lý thuế (có hiệu lực từ ngày 1-7-2007). “Trong trường hợp các văn bản quy phạm pháp luật quy định khác nhau về cùng một vấn đề thì áp dụng văn bản có hiệu lực pháp lý cao hơn” - Tổng cục Thuế giải thích.

Theo Luật Quản lý thuế thì tỉ lệ chậm nộp là 0,05%/ngày, thời gian tính là từ khi Luật Quản lý thuế có hiệu lực đến ngày 1-7-2016. Trong văn bản phản hồi, Tổng cục Thuế cũng lưu ý: Do không có đầy đủ hồ sơ, tư liệu, đề nghị Cục Thuế tỉnh Đồng Tháp căn cứ hồ sơ cụ thể của HIDICo để xác định khoản tiền tương đương với tiền chậm nộp.

Sau khi có hướng dẫn của Tổng cục Thuế, ngày 19-9 vừa qua, UBND tỉnh Đồng Tháp có công văn điều chỉnh tiền thuê đất đối với HIDICo (chỉ giảm hơn 226 triệu đồng so với ban đầu, thay vì giảm hơn 3 tỉ đồng theo kết luận thanh tra).

Ông Nguyễn Quang Chí, Giám đốc Tài chính của HIDICo, cho rằng việc tính tiền thuê đất đối với HIDICo nhiều bất cập, gây bất lợi cho doanh nghiệp như tính cả tiền đất hạ tầng khu công nghiệp dùng chung bắt HIDICo chịu; chưa tính khoản ưu đãi đầutư cho công ty; đặc biệt là việc áp dụng luật chưa phù hợp để tính khoản tiền tương đương tiền chậm nộp tiền thuê đất khiến doanh nghiệp thiệt hại hàng tỉ đồng.

Ông Nguyễn Tấn Ngân, Tổng Giám đốc HIDICo, khẳng định quy định của pháp luật rất rõ về việc tiền thuê đất được tính là khoản tiền tương đương tiền chậm nộp tiền thuê đất và việc chậm nộp thuế là hai vấn đề hoàn toàn khác nhau. “Việc chậm nộp tiền thuê đất của chúng tôi được quy định tại Nghị định 142/2005. Trong khi đó, UBND tỉnh lại áp dụng quy định về việc chậm nộp thuế cho chúng tôi là không hợp lý, gây thiệt hại lớn cho doanh nghiệp” - ông bày tỏ.

Hiện doanh nghiệp này đang kiến nghị UBND tỉnh xem xét lại việc xử phạt nói trên.