Câu hỏi: Công ty tôi là công ty mẹ của một con dưới hình thức là công ty TNHH một thành viên. Công ty này lại là chủ đầu tư của một dự án bất động sản. Hiện nay do có một số khó khăn trong quá trình thực hiện, trong đó có vấn đề vốn và kinh nghiệm quản lý dự án, công ty tôi muốn chuyển nhượng dự án mà công ty con đang thực hiện cho một đối tác khác, sau đó giải thể công ty con này. Nhưng có một số vấn đề pháp lý liên quan đến việc chuyển nhượng dự án, trong đó có các vấn đề thuế nên chưa đi đến quyết định. Đề nghị Quý công ty tư vấn cho chúng tôi về một số vấn đề như sau:  

1. Khoản 4 Điều 5 Thông tư số 219/2013/TT-BTC của Bộ tài chính quy định về việc chuyển nhượng dự án thì việc chuyển nhượng dự án đầu tư đang dở dang chưa đi vào hoạt động thuộc diện được miễn tính thuế giá trị gia tăng (VAT), có nghĩa là không phải kê khai và tính nộp thuế giá trị gia tăng. Vậy tôi muốn biết chuyển nhượng dự án bất động sản có được miễn thuế giá trị gia tăng như chuyển nhượng dự án đầu tư nói chung hay không?

2. Nếu công ty tôi chuyển nhượng dự án cho đối tác xong cho đối tác, rồi thực hiện giải thể công ty con là chủ dự án, thì có được hoàn khoản thuế giá trị gia tăng đầu vào của dự án không ( vì không phải nộp thuế giá trị gia tăng đầu ra).
(Công ty CP Đầu tư xây dựng Sơn Hà)

• Bên chuyển nhượng dự án khi điều chỉnh giảm thuế giá trị gia tăng (VAT) đầu ra dẫn đến phát sinh số thuế giá trị gia tăng nộp thừa thì có quyền giải quyết tiền thuế nộp thừa theo quy định tại Điều 33 Thông tư số 156/2013/TT-BTC. Tuy nhiên, đối với trường hợp chuyển nhượng dự án đồng thời giải thể doanh nghiệp thì không được giải quyết hoàn thuế nộp thừa.
• Bên nhận chuyển nhượng khi điều chỉnh giảm thuế giá trị gia tăng (VAT) đầu vào dẫn đến giảm số thuế giá trị gia tăng (VAT) được khấu trừ, nếu đã được hoàn thuế thì phải truy nộp lại số thuế được hoàn đồng thời bị tính tiền chậm nộp; nếu làm tăng số thuế gia trị gia tăng (VAT) phải nộp thì phải nộp đủ số thuế tăng thêm đồng thời chịu thêm tiền chậm nộp.